یک دسته عفونت‌ها كه می‌توانند از طریق شنا كردن در آب منتقل شوند، عفونت‌های ویروسی هستند كه مهم‌ترین آنها هپاتیت A است. ثابت شده هپاتیت B و C و HIV نمی‌توانند از طریق آب استخر منتقل شوند زیرا این ویروس‌ها در برابر مواد ضدعفونی‌كننده و اشعه آفتاب بسیار حساس هستند و به سرعت از بین می‌روند، اما ویروس هپاتیت A مقاوم‌تر است و انتقال آن از طریق مدفوعی- دهانی صورت می‌گیرد بنابراین اگر فرد مبتلا بهداشت را رعایت نكند، می‌تواند این ویروس را وارد آب كند و افرادی كه در آب شنا می‌كنند، می‌توانند با بلعیدن آب یا از طریق جذب مخاط بینی و چشم این ویروس را وارد بدنشان كنند. در واقع هر فردی كه وارد آب می‌شود، می‌تواند مقدار بسیار كمی (در حد میكروسكوپی) از ذرات مدفوع را وارد آب كند، در نتیجه آلوده شدن آب از این طریق خیلی بعید و غیرمعمول نیست.
